把保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。
预付款保函：
是指银行(担保人)应交易合同中的一方当事人(申请人)的请求，开立的以另一方当事人为受益人的保函，在申请人没有履行合同中规定的义务时，银行将保证偿还受益人预付或已付给申请人的金额。
履约保函的优点：
对承包方或供货方：
减少由于缴纳现金保证金引起的长时间资金占压，获得资金收益；
与缴纳现金保证金相比，可以使有限的资金得到优化配置；
权益得到更好地维护。
对业主或买方：
合理制约承包人、供货方行为，良好维护自身利益；
避免收取、退回保证金程序的繁琐，提高工作效率。
履约保函和保证金的区别：
履约保函和保证金的区别在于履约保函在办理的时候手续非常的繁琐，但是在保函当中会有一个明确的有效期，在到了这天之后，乙方的钱就会自动从银行获得自由，而不需要甲方同意或者是不同意。
而办理履约保证金的话，那么总体的手续就比较简单了，只需要直接交钱给买方或者是是交易中心，就能够对于我们的合同进行现金的保障，但是履约保证金只能够保证合同的正常进行，到了约定时间之后，我们的本金并不是能够马上就收回来的。
因此，双方选择履约保函是一个比较明智的选择。